Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpn5P54830 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn5P54830 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms