Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nub1P54729 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nub1P54729 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nub1P54729 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nub1P54729 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nub1P54729 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nub1P54729 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nub1P54729 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nub1P54729 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nub1P54729 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms