Protein–RNA interactions for Protein: P53783

Sox1, Transcription factor SOX-1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox1P53783 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox1P53783 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox1P53783 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox1P53783 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox1P53783 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox1P53783 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox1P53783 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox1P53783 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox1P53783 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox1P53783 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox1P53783 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox1P53783 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox1P53783 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sox1P53783 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox1P53783 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox1P53783 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms