Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PklrP53657 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PklrP53657 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PklrP53657 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PklrP53657 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PklrP53657 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PklrP53657 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PklrP53657 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PklrP53657 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PklrP53657 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PklrP53657 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PklrP53657 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PklrP53657 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PklrP53657 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PklrP53657 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PklrP53657 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PklrP53657 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PklrP53657 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PklrP53657 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PklrP53657 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PklrP53657 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PklrP53657 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PklrP53657 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PklrP53657 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PklrP53657 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PklrP53657 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PklrP53657 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PklrP53657 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PklrP53657 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PklrP53657 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PklrP53657 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PklrP53657 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PklrP53657 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PklrP53657 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PklrP53657 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PklrP53657 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PklrP53657 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PklrP53657 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PklrP53657 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PklrP53657 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PklrP53657 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PklrP53657 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PklrP53657 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PklrP53657 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PklrP53657 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PklrP53657 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PklrP53657 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PklrP53657 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PklrP53657 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PklrP53657 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PklrP53657 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PklrP53657 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PklrP53657 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PklrP53657 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PklrP53657 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PklrP53657 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PklrP53657 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms