Protein–RNA interactions for Protein: P53368

Nudt1, 7,8-dihydro-8-oxoguanine triphosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt1P53368 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt1P53368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt1P53368 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudt1P53368 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt1P53368 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms