Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SqleP52019 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SqleP52019 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SqleP52019 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SqleP52019 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SqleP52019 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SqleP52019 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SqleP52019 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SqleP52019 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SqleP52019 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SqleP52019 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SqleP52019 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SqleP52019 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SqleP52019 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SqleP52019 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SqleP52019 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SqleP52019 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SqleP52019 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SqleP52019 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SqleP52019 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SqleP52019 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SqleP52019 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SqleP52019 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SqleP52019 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SqleP52019 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SqleP52019 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SqleP52019 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SqleP52019 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SqleP52019 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SqleP52019 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SqleP52019 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SqleP52019 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SqleP52019 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SqleP52019 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SqleP52019 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SqleP52019 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SqleP52019 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SqleP52019 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SqleP52019 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SqleP52019 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SqleP52019 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SqleP52019 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SqleP52019 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SqleP52019 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SqleP52019 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SqleP52019 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SqleP52019 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SqleP52019 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SqleP52019 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SqleP52019 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SqleP52019 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SqleP52019 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SqleP52019 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SqleP52019 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SqleP52019 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SqleP52019 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SqleP52019 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SqleP52019 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SqleP52019 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SqleP52019 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SqleP52019 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SqleP52019 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SqleP52019 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SqleP52019 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SqleP52019 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SqleP52019 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SqleP52019 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SqleP52019 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SqleP52019 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SqleP52019 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SqleP52019 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SqleP52019 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SqleP52019 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SqleP52019 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SqleP52019 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SqleP52019 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SqleP52019 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SqleP52019 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SqleP52019 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SqleP52019 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SqleP52019 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SqleP52019 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SqleP52019 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SqleP52019 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SqleP52019 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SqleP52019 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SqleP52019 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.9 ms