Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApodP51910 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApodP51910 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApodP51910 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApodP51910 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApodP51910 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ApodP51910 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApodP51910 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApodP51910 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApodP51910 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApodP51910 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApodP51910 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApodP51910 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ApodP51910 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ApodP51910 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ApodP51910 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ApodP51910 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ApodP51910 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ApodP51910 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ApodP51910 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ApodP51910 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ApodP51910 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ApodP51910 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ApodP51910 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ApodP51910 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ApodP51910 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ApodP51910 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ApodP51910 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ApodP51910 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ApodP51910 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ApodP51910 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ApodP51910 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ApodP51910 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ApodP51910 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApodP51910 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ApodP51910 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ApodP51910 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ApodP51910 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ApodP51910 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ApodP51910 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ApodP51910 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ApodP51910 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ApodP51910 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ApodP51910 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ApodP51910 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ApodP51910 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ApodP51910 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms