Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a1P51906 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc1a1P51906 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms