Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr4P51680 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr4P51680 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr4P51680 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr4P51680 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccr4P51680 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr4P51680 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr4P51680 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms