Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defa-rs12P50716 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs12P50716 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Defa-rs12P50716 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Defa-rs12P50716 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms