Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpreP49446 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpreP49446 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpreP49446 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpreP49446 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpreP49446 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtpreP49446 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtpreP49446 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpreP49446 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpreP49446 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtpreP49446 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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