Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prox1P48437 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prox1P48437 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prox1P48437 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prox1P48437 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prox1P48437 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prox1P48437 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prox1P48437 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prox1P48437 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms