Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbx2P48031 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbx2P48031 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbx2P48031 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms