Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CratP47934 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CratP47934 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CratP47934 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CratP47934 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CratP47934 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CratP47934 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CratP47934 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CratP47934 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CratP47934 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CratP47934 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CratP47934 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CratP47934 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CratP47934 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CratP47934 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CratP47934 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CratP47934 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CratP47934 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CratP47934 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CratP47934 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CratP47934 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CratP47934 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CratP47934 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CratP47934 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms