Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn1bP46414 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn1bP46414 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms