Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sdc2P43407 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sdc2P43407 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdc2P43407 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms