Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec3bP43025 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec3bP43025 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec3bP43025 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clec3bP43025 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Clec3bP43025 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec3bP43025 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms