Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pik3caP42337 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pik3caP42337 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3caP42337 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms