Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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