Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf2P39429 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf2P39429 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf2P39429 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf2P39429 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf2P39429 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf2P39429 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms