Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TtlP38585 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TtlP38585 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtlP38585 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtlP38585 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtlP38585 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TtlP38585 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TtlP38585 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TtlP38585 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TtlP38585 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtlP38585 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtlP38585 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TtlP38585 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TtlP38585 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TtlP38585 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtlP38585 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtlP38585 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtlP38585 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TtlP38585 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtlP38585 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TtlP38585 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TtlP38585 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtlP38585 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TtlP38585 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TtlP38585 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtlP38585 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtlP38585 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtlP38585 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtlP38585 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtlP38585 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtlP38585 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtlP38585 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtlP38585 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtlP38585 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TtlP38585 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtlP38585 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtlP38585 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtlP38585 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtlP38585 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtlP38585 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TtlP38585 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms