Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk2P38575 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk2P38575 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk2P38575 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk2P38575 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk2P38575 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk2P38575 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk2P38575 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk2P38575 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 545 ms