Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpargP37238 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpargP37238 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpargP37238 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpargP37238 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpargP37238 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpargP37238 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpargP37238 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpargP37238 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpargP37238 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PpargP37238 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpargP37238 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpargP37238 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpargP37238 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpargP37238 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpargP37238 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpargP37238 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpargP37238 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpargP37238 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpargP37238 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpargP37238 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpargP37238 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PpargP37238 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpargP37238 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpargP37238 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpargP37238 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpargP37238 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpargP37238 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpargP37238 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PpargP37238 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpargP37238 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpargP37238 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpargP37238 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpargP37238 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpargP37238 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpargP37238 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpargP37238 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpargP37238 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpargP37238 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpargP37238 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpargP37238 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PpargP37238 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PpargP37238 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpargP37238 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PpargP37238 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PpargP37238 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PpargP37238 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpargP37238 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpargP37238 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpargP37238 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpargP37238 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpargP37238 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpargP37238 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpargP37238 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpargP37238 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpargP37238 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpargP37238 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpargP37238 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpargP37238 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpargP37238 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpargP37238 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpargP37238 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PpargP37238 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpargP37238 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpargP37238 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpargP37238 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpargP37238 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpargP37238 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms