Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfc1P35601 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfc1P35601 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfc1P35601 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms