Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptger1P35375 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptger1P35375 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptger1P35375 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptger1P35375 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms