Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptk2P34152 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptk2P34152 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptk2P34152 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms