Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnar1P33896 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnar1P33896 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms