Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim2P33610 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prim2P33610 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim2P33610 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prim2P33610 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prim2P33610 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim2P33610 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim2P33610 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim2P33610 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim2P33610 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim2P33610 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim2P33610 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim2P33610 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim2P33610 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prim2P33610 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms