Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh15P33146 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh15P33146 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh15P33146 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh15P33146 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms