Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd28P31041 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd28P31041 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd28P31041 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd28P31041 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd28P31041 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd28P31041 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd28P31041 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms