Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccnd3P30282 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnd3P30282 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnd3P30282 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd3P30282 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms