Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1P29341 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc1P29341 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc1P29341 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1P29341 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms