Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca8P28651 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca8P28651 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca8P28651 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca8P28651 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms