Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col2a1P28481 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col2a1P28481 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col2a1P28481 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col2a1P28481 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms