Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb1P28230 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb1P28230 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb1P28230 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms