Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmb8P28063 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb8P28063 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms