Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CftrP26361 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CftrP26361 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CftrP26361 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CftrP26361 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CftrP26361 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CftrP26361 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CftrP26361 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CftrP26361 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CftrP26361 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CftrP26361 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CftrP26361 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CftrP26361 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CftrP26361 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CftrP26361 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CftrP26361 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CftrP26361 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CftrP26361 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CftrP26361 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CftrP26361 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CftrP26361 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CftrP26361 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CftrP26361 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CftrP26361 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CftrP26361 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CftrP26361 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CftrP26361 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CftrP26361 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CftrP26361 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CftrP26361 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CftrP26361 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CftrP26361 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CftrP26361 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CftrP26361 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CftrP26361 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CftrP26361 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CftrP26361 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CftrP26361 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CftrP26361 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CftrP26361 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CftrP26361 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CftrP26361 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CftrP26361 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CftrP26361 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CftrP26361 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CftrP26361 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CftrP26361 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CftrP26361 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CftrP26361 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CftrP26361 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CftrP26361 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CftrP26361 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CftrP26361 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CftrP26361 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CftrP26361 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CftrP26361 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CftrP26361 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CftrP26361 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CftrP26361 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CftrP26361 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CftrP26361 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CftrP26361 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CftrP26361 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CftrP26361 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CftrP26361 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CftrP26361 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CftrP26361 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CftrP26361 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CftrP26361 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CftrP26361 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CftrP26361 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CftrP26361 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CftrP26361 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CftrP26361 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CftrP26361 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CftrP26361 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CftrP26361 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CftrP26361 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CftrP26361 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CftrP26361 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CftrP26361 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CftrP26361 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CftrP26361 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CftrP26361 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CftrP26361 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CftrP26361 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CftrP26361 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CftrP26361 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CftrP26361 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CftrP26361 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CftrP26361 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CftrP26361 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CftrP26361 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms