Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bmi1P25916 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bmi1P25916 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bmi1P25916 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms