Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax3P24610 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax3P24610 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax3P24610 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax3P24610 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pax3P24610 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax3P24610 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax3P24610 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax3P24610 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax3P24610 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax3P24610 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax3P24610 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax3P24610 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax3P24610 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax3P24610 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax3P24610 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms