Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria2P23819 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria2P23819 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria2P23819 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria2P23819 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria2P23819 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria2P23819 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms