Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Eif3aP23116 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Eif3aP23116 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif3aP23116 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Eif3aP23116 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Eif3aP23116 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif3aP23116 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif3aP23116 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.6 ms