Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnc1P19123 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnc1P19123 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnnc1P19123 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms