Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim30aP15533 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30aP15533 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30aP15533 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30aP15533 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms