Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DmdP11531 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DmdP11531 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DmdP11531 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DmdP11531 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DmdP11531 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DmdP11531 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DmdP11531 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DmdP11531 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DmdP11531 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DmdP11531 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DmdP11531 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DmdP11531 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DmdP11531 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DmdP11531 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DmdP11531 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DmdP11531 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DmdP11531 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DmdP11531 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DmdP11531 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DmdP11531 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DmdP11531 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DmdP11531 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DmdP11531 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DmdP11531 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DmdP11531 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DmdP11531 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DmdP11531 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DmdP11531 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DmdP11531 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DmdP11531 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DmdP11531 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DmdP11531 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DmdP11531 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DmdP11531 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DmdP11531 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DmdP11531 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DmdP11531 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DmdP11531 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DmdP11531 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DmdP11531 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DmdP11531 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DmdP11531 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DmdP11531 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DmdP11531 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DmdP11531 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DmdP11531 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DmdP11531 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DmdP11531 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DmdP11531 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DmdP11531 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DmdP11531 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DmdP11531 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DmdP11531 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DmdP11531 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DmdP11531 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DmdP11531 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DmdP11531 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DmdP11531 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DmdP11531 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DmdP11531 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DmdP11531 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DmdP11531 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DmdP11531 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DmdP11531 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DmdP11531 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DmdP11531 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DmdP11531 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DmdP11531 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DmdP11531 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DmdP11531 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DmdP11531 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DmdP11531 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms