Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fv4P11370 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fv4P11370 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fv4P11370 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fv4P11370 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fv4P11370 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fv4P11370 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fv4P11370 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fv4P11370 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fv4P11370 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fv4P11370 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms