Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6P10629 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc6P10629 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6P10629 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms