Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna9P09235 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna9P09235 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna9P09235 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms