Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifna5P07349 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna5P07349 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms