Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TnfP06804 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TnfP06804 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TnfP06804 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TnfP06804 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TnfP06804 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TnfP06804 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TnfP06804 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TnfP06804 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TnfP06804 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnfP06804 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnfP06804 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TnfP06804 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnfP06804 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnfP06804 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnfP06804 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnfP06804 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnfP06804 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnfP06804 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnfP06804 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnfP06804 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnfP06804 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnfP06804 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnfP06804 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnfP06804 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnfP06804 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TnfP06804 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TnfP06804 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnfP06804 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnfP06804 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnfP06804 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnfP06804 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnfP06804 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnfP06804 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnfP06804 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnfP06804 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnfP06804 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnfP06804 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnfP06804 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnfP06804 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnfP06804 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnfP06804 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnfP06804 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnfP06804 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnfP06804 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnfP06804 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TnfP06804 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TnfP06804 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnfP06804 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnfP06804 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnfP06804 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnfP06804 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnfP06804 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnfP06804 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnfP06804 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TnfP06804 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnfP06804 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnfP06804 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnfP06804 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnfP06804 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnfP06804 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnfP06804 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnfP06804 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnfP06804 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TnfP06804 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TnfP06804 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TnfP06804 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TnfP06804 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TnfP06804 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TnfP06804 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TnfP06804 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TnfP06804 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TnfP06804 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TnfP06804 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TnfP06804 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TnfP06804 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TnfP06804 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TnfP06804 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TnfP06804 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TnfP06804 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms