Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb1bP06795 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb1bP06795 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb1bP06795 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms